电子学院现有实验室8个,其中学科实验室5个,教学实验室3个。
学科实验室：
  国家专用集成电路系统工程技术研究中心
  东南大学MEMS教育部重点实验室
  东南大学显示技术研究中心暨江苏省信息显示工程技术研究中心
  东南大学先进光子学中心
  东南大光传感/通信综合网络国家（地方）联合工程研究中心
教学实验室包括：
嵌入式系统实验室
  光电子物理实验室
  本科生创新实验室（九龙湖） 

各教学实验室负责老师
  光电子物理实验室: 吴旭峰   钟嫄
  嵌入式系统实验室: 朱为   史小军   赵宁   朱萍  董志芳   贺晋   范卫政    岳辉    张琴
  创新实验室:  赵宁  贺晋